在指揮暨藝術總監蘇慶俊老師對音樂精闢的詮釋、對聲音嚴格的要求，及對台灣合唱音樂發展強烈的使命感驅使下，除了舉辦並參與各類型音樂會活動外，更計劃性地錄製有聲出版品，為台灣合唱音樂保存做出貢獻。二十年來，本團所錄製出版 ( 含委託創作或錄製) 之專輯已達二十餘片，其中的十三張專輯，更榮獲金曲獎『傳統暨藝術音樂作品類』多項入圍與得獎的肯定，堪稱是國內金曲獎的常勝軍，其中《台灣是寶島》專輯，更曾獲得誠品書店「暢銷古典專輯類」排行榜第一名。

福爾摩沙合唱團所錄製的有聲出版品，合作對象包括蕭泰然、鄭智仁、劉志明、駱維道與其他眾多作詞、作曲與編曲之文學家與音樂家，所使用語言則包括台（福佬）語、客語及各族原住民語。其中 2004 年曾受行政院客委會委託，錄製發行「客家歌謠曲譜選集」專輯，成為合唱界演唱「新客家歌謠」的先軀，所收錄作品也廣為國內合唱團體演唱；2010 年出版由蔡昱姍改編之台語聖詩專輯《至好朋友就是耶穌》，同樣樹立了台語聖詩新典範，不僅引起廣大迴響，也成為台灣基督教會與信徒學習與演唱的曲目。

此外，本團根據國際知名合唱指揮大師來台客席音樂會現場錄音發行「大師系列音樂會」系列專輯，曲目類型包羅萬象，同樣也多次獲得金曲獎入圍與獲獎之肯定。